法律分析：1、贷款利率不同：商贷的基准利率是4.9%，公积金贷款5年以上基准利率是3.25%。2、贷款比例不同：同样一套房子，商业贷款如果是首套能贷7成，那么纯公积金贷款首套最多可以贷到8成。3、贷款的流程不同：商业贷款要在办理过户之前审核贷款，而公积金贷款是在办理过户之后审核贷款。4、审批时间不同：商业贷款大约20个工作日，公积金贷款大约需要40个工作日，商业贷款快于公积金贷款。5、贷款来源不同：商业贷款放款源头的来源主要是商业银行等放贷机构筹集的社会公众资金，而公积金房屋贷款则是公积金缴费者缴纳的资金。6、使用人群不同：商业房贷针对所有符合条件的社会公众开放，而公积金贷款则只对公积金缴纳者开放。7、利息用途不同：商业房贷的利息是商业行为的盈利，归相关的投资人所有，而公积金利息则是有政策规定用途，只能用于保障性住房建设。
法律依据：《住房公积金管理条例》 第二十六条 缴存住房公积金的职工，在购买、建造、翻建、大修自住住房时，可以向住房公积金管理中心申请住房公积金贷款。住房公积金管理中心应当自受理申请之日起15日内作出准予贷款或者不准贷款的决定，并通知申请人；准予贷款的，由受委托银行办理贷款手续。住房公积金贷款的风险，由住房公积金管理中心承担。